ECZAKDER İktisadi İşletmesi 28 Mayıs 2018 tarihinde kurulmuş ve ECZAKDER ve ECZAK kurullarının dışından bir müdür atanmıştır. Kurulduğu tarihten itibaren İktisadi İşletmede çalışmalar bir mali müşavir ile yürütülmektedir. İktisadi İşletmenin öncelikli amacı ECZAKDER’in mali olarak büyümesine yönelik faaliyetleri sürdürmektir. Bu amaçla, kurulduğu 2 yılı aşkın süreden beri tüm eczacılık eğitimi programları akreditasyon başvuru bedelleri bu işletme üzerinden alınmaktadır. Eğitim, akreditasyon ve kalite standartlarına yönelik eğitim programları düzenleyerek mali gelirlerin artırılması amaçlanmaktadır.